方小卫一家三口为实控人。爱科科技实际控制人为方小卫及配偶徐帷红、儿子方云科。其中，方小卫与徐帷红通过爱科电脑间接持有公司合计49.3410%的股份；方云科直接持有10.6471%的股份，方云科作为瑞步投资和瑞松投资的执行事务合伙人可以控制瑞步投资和瑞松投资分别持有的7.1041%和5.7545%股权的表决权，方云科能够控制爱科科技合计23.5057%的表决权。因此，方小卫、徐帷红和方云科合计能控制爱科科技72.8467%的股份，为公司的实际控制人。

方小卫，1957年出生，1989年毕业于浙江大学，研究生学历。教授级高级工程师。现任杭州爱科科技股份有限公司董事长兼总工程师、杭州爱科电脑技术有限公司执行董事。徐帷红，1960年出生，大专学历。高级工程师。现任杭州爱科科技股份有限公司顾问。1979年至1993年曾任职于杭州自动化研究所软件研究室。方云科，1984年出生，2008年毕业于英国华威大学，研究生学历。高级工程师。现任杭州爱科科技股份有限公司总经理、杭州爱科机器人技术有限公司总经理、杭州丰云信息技术有限公司总经理、杭州爱科自动化技术有限公司总经理、杭州瑞松投资管理合伙企业(有限合伙)和杭州瑞步投资管理合伙企业(有限合伙)之执行事务合伙人。2008年至2009年曾任职于阿里巴巴。